RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CD27-AS1-204ENST00000504270 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.87□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.87□□□□□ -0.51
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CD27-AS1-204ENST00000504270 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.87□□□□□ -0.51
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CD27-AS1-204ENST00000504270 PODXLO00592 558 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 CETN3O15182 167 aa11.86□□□□□ -0.51
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CD27-AS1-204ENST00000504270 B3GAT3O94766 335 aa11.86□□□□□ -0.51
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CD27-AS1-204ENST00000504270 NFICP08651 508 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 SP9P0CG40 484 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNNI1P19237 187 aa11.86□□□□□ -0.51
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