RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	IPP	Q9Y573	584 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PIR	O00625	290 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP26A1	O43174	497 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	HOXA2	O43364	376 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRN2	O75325	713 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SGPL1	O95470	568 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ITGB3	P05106	788 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TH	P07101	528 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CKB	P12277	381 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CCL5	P13501	91 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT5	P13647	590 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	USP8	P40818	1118 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	WNT7B	P56706	349 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	OSTN	P61366	133 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TNNC1	P63316	161 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TAP1	Q03518	808 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SV2C	Q496J9	727 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CISH	Q9NSE2	258 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NCAN	O14594	1321 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CILP	O75339	1184 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CALB1	P05937	261 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TUBB	P07437	444 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NFIC	P08651	508 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT19	P08727	400 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	VDR	P11473	427 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GNA15	P30679	374 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RFC2	P35250	354 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ASPA	P45381	313 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TAF6	P49848	677 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GALC	P54803	685 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FMO1	Q01740	532 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	APBA1	Q02410	837 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CENPC	Q03188	943 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ITIH3	Q06033	890 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LPIN1	Q14693	890 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CNGA2	Q16280	664 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MNS1	Q8NEH6	495 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms