RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CIB1Q99828 191 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C8orf4Q9NR00 106 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DSEQ9UL01 958 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TIPRLO75663 272 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DGKIO75912 1065 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DDHD2O94830 711 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ASGR1P07306 291 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCY1A2P33402 732 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT20P35900 424 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.635e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-213ENST00000496055 AP3M2P53677 418 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC12A2P55011 1212 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STRA8Q7Z7C7 330 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ERICH1Q86X53 443 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP10Q92851 521 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM122AQ96E09 287 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 THAP11Q96EK4 314 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC42Q96M95 316 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX25Q9H3E2 840 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CRLF2Q9HC73 371 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 COG5Q9UP83 839 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ROBO3Q96MS0 1386 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GUL6 1792 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM170AA1A519 330 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO9A1A5B4 782 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CETN3O15182 167 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GPAA1O43292 621 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB14O43829 449 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LCA5LO95447 670 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TGDSO95455 350 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM11P17152 192 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF76P36508 570 aa4.86□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL4Q14679 1199 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 P3H1Q32P28 736 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT7Q86SF2 657 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TLK2Q86UE8 772 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GMCL1Q96IK5 515 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CMTM3Q96MX0 182 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A7Q96T83 725 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NDNQ99608 321 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PSTPIP2Q9H939 334 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PIDD1Q9HB75 910 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PARVBQ9HBI1 364 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EMC3Q9P0I2 261 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STX6O43752 255 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SASH3O75995 380 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC24BO95487 1268 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPH10BP0C881 870 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CTRB1P17538 263 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNSP34059 522 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ASMTP46597 345 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 THOP1P52888 689 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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