RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488033.5

HCLS1-209, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 4

Gene HCLS1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-209ENST00000488033 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 ITPR1Q14643 2758 aa14.79□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 CPLX1O14810 134 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 ATG13O75143 517 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 RHOBTB1O94844 696 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 CAVIN2O95810 425 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 EDN1P05305 212 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 CEACAM1P13688 526 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 CPB1P15086 417 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 ATP2B1P20020 1258 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 ELF2Q15723 593 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF280DQ6N043 979 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 FBXL16Q8N461 479 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 TMEM209Q96SK2 561 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 MAFFQ9ULX9 164 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 LAMA5O15230 3695 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 NUP205Q92621 2012 aa14.78□□□□□ -0.04
HCLS1-209ENST00000488033 RPS6KB1P23443 525 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TNK2Q07912 1038 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 DEPTORQ8TB45 409 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 YIPF1Q9Y548 306 aa14.77□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 LNP1A1A4G5 178 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TAF4O00268 1085 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 DCLK1O15075 740 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 PLCB2Q00722 1185 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 PLD1Q13393 1074 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 PTPAQ15257 358 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TMC8Q8IU68 726 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 APPL2Q8NEU8 664 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 BSNDQ8WZ55 320 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 KIF12Q96FN5 646 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 HHIPQ96QV1 700 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 LRRC3Q9BY71 257 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.76□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 MCM4P33991 863 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 EPHB3P54753 998 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 EVCP57679 992 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 OSTNP61366 133 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 GPR158Q5T848 1215 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 DEFB124Q8NES8 71 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 DDX12PQ92771 950 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 KCNB2Q92953 911 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 OBP2AQ9NY56 170 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.75□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 THADAQ6YHU6 1953 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 RNF40O75150 1001 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 GBP1P32455 592 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 NAMPTP43490 491 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ALDH1A3P47895 512 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 CEP120Q8N960 986 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 OXER1Q8TDS5 423 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 SUSD3Q96L08 255 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.74□□□□□ -0.05
HCLS1-209ENST00000488033 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms