RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 NPTX2P47972 431 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PEX3P56589 373 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 DSC1Q08554 894 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GRIK3Q13003 919 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RESTQ13127 1097 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 LILRA6Q6PI73 481 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KBTBD6Q86V97 674 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 FGF13Q92913 245 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CALML4Q96GE6 196 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CRELD1Q96HD1 420 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFP42Q96MM3 310 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLIN2Q99541 437 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MARCH5Q9NX47 278 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MIOSQ9NXC5 875 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KCND2Q9NZV8 630 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PARP2Q9UGN5 583 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 C4orf47A7E2U8 309 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC16A4O15374 487 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NR1I2O75469 434 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RECQL4O94761 1208 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GLUD1P00367 558 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLA2G4BP0C869 781 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 UBA7P41226 1012 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RAP1GAPP47736 663 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 OR1G1P47890 313 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NRLP54845 237 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC12A3P55017 1021 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GRIN1Q05586 938 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PTPAQ15257 358 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX21Q969T3 373 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PIDD1Q9HB75 910 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SNTG2Q9NY99 539 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KLK14Q9P0G3 267 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CDH7Q9ULB5 785 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 USP20Q9Y2K6 914 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CLIC4Q9Y696 253 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CACNA1EQ15878 2313 aa7.04□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 MGAQ8IWI9 3026 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SFI1A8K8P3 1242 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PTGESO14684 152 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 STX6O43752 255 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 EPN2O95208 641 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SOD2P04179 222 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 URODP06132 367 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 THP07101 528 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 CHRNB1P11230 501 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLS3P13797 630 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 PLCG1P19174 1290 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 SMTNP53814 917 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TUSC3Q13454 348 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 GRM2Q14416 872 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF43Q68DV7 783 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZS52 159 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDSPL-208ENST00000486978 LONP2Q86WA8 852 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms