RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 VCAM1P19320 739 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MKNK1Q9BUB5 465 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 USTQ9Y2C2 406 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TMX2Q9Y320 296 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD10O75832 226 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HAUS5O94927 633 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCNB1P14635 433 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PLCB3Q01970 1234 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf186Q6ZWK4 172 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF333Q96JL9 665 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM210AQ96ND0 272 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 BTNL10A8MVZ5 291 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TJP3O95049 919 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CETPP11597 493 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SOX10P56693 466 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IZUMO2Q6UXV1 221 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ANKLE1Q8NAG6 615 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF653Q96CK0 615 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 COL20A1Q9P218 1284 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf71A6NGG8 1288 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IFNB1P01574 187 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NEK3P51956 506 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R5CQ13362 524 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 KAZNQ674X7 775 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PADI6Q6TGC4 694 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MOXD1Q6UVY6 613 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 JDP2Q8WYK2 163 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CHST7Q9NS84 486 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ARMCX1Q9P291 453 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HEY2Q9UBP5 337 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TBX10O75333 385 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PLS3P13797 630 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ITGB5P18084 799 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN4P29074 926 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FMO5P49326 533 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PARP6Q2NL67 630 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C2CD6Q53TS8 623 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf163Q5TEZ5 329 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA6P17066 643 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CIITAP33076 1130 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NPEPPSP55786 919 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STYK1Q6J9G0 422 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NACC1Q96RE7 527 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SIX2Q9NPC8 291 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 USP20Q9Y2K6 914 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 WASHC2DQ5SRD0 308 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CBWD1Q9BRT8 395 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NINJ2Q9NZG7 142 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 WFS1O76024 890 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PGM1P36871 562 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MARSP56192 900 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MYL7Q01449 175 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf50Q6ZRC1 276 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRKAG3Q9UGI9 489 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP42A6NI28 874 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 EGFRP00533 1210 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CALCAP01258 141 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB3P29508 390 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GPC5P78333 572 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms