RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.96□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PTPRDP23468 1912 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PRU2 124 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 M0R2N6 131 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TBX3O15119 743 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 VNN2O95498 520 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 APBB3O95704 486 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EGFP01133 1207 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 BCKDHBP21953 392 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 WEE1P30291 646 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RCAN1P53805 252 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ARPP19P56211 112 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PLCB2Q00722 1185 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TFDP1Q14186 410 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NECTIN1Q15223 517 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 XKR9Q5GH70 373 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GAREM2Q75VX8 874 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SYT13Q7L8C5 426 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ELMOD1Q8N336 334 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 BEST2Q8NFU1 509 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 BICD2Q8TD16 824 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LXNQ9BS40 222 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FZD8Q9H461 694 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 HPS4Q9NQG7 708 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MAFFQ9ULX9 164 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 INVSQ9Y283 1065 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RAXQ9Y2V3 346 aa7.95□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SYN3O14994 580 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TRAPPC3O43617 180 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SLC37A4O43826 429 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PRAMEF12O95522 483 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EDN1P05305 212 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PLA2G2AP14555 144 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ENGP17813 658 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GBP1P32455 592 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LMAN2Q12907 356 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DMC1Q14565 340 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 EPHA7Q15375 998 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FAM187BQ17R55 369 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf74Q86VG3 221 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RASSF3Q86WH2 238 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 MDM1Q8TC05 714 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CRELD1Q96HD1 420 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 UROC1Q96N76 676 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RGL1Q9NZL6 768 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 YIPF1Q9Y548 306 aa7.94□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 ATMQ13315 3056 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 H7C4K7 107 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 TK2O00142 265 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DPYSL4O14531 572 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 N4BP3O15049 544 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DRD1P21728 446 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 GALK1P51570 392 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 DGKEP52429 567 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 RUNX3Q13761 415 aa7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CASQ1-203ENST00000481081 NTRK3Q16288 839 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 202.1 ms