RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF292O60281 2723 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SFI1A8K8P3 1242 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 K7ERI5 159 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MAN2B1O00754 1011 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ABLIM1O14639 778 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PRRG1O14668 218 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC3O43617 180 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 VNN2O95498 520 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNB1P11230 501 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MYL4P12829 197 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 GRM5P41594 1212 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 EFNA5P52803 228 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PEX3P56589 373 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP8P85298 464 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SEZ6Q53EL9 994 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 DAW1Q8N136 415 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 DNASE1L2Q92874 299 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 IFT74Q96LB3 600 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC169A6NNP5 214 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 E9PMD0 336 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ARNTLO00327 626 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF197O14709 1029 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 RNF40O75150 1001 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MICAL2O94851 1124 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 OR52Z1P0C646 297 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 KCNE1P15382 129 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PSMC3P17980 439 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CCNE1P24864 410 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 NPTX2P47972 431 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SOX9P48436 509 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 FNTBP49356 437 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 LMNB2Q03252 620 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TWF1Q12792 350 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PPP2R5AQ15172 486 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TEAD2Q15562 447 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TTC8Q8TAM2 541 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCD2Q92925 531 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 IRF7Q92985 503 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ACAP3Q96P50 834 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 RTKNQ9BST9 563 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC3Q9BY71 257 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 H7C4K7 107 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF263O14978 683 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SYN3O14994 580 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 GDF9O60383 454 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 OR4Q2P0C623 313 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SDHBP21912 280 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PROZP22891 400 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 CXCL12P48061 93 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 EPHA5P54756 1037 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SPAG1Q07617 926 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK7Q13164 816 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD1Q15327 319 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 IL17AQ16552 155 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TPGS2Q68CL5 300 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ERMNQ8TAM6 284 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 KIFAP3Q92845 792 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 SUSD3Q96L08 255 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-208ENST00000479480 TCHPQ9BT92 498 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms