RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	TNNC2	P02585	160 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ADH1A	P07327	375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TNNI1	P19237	187 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TYMP	P19971	482 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFV1	P49821	464 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CLCN4	P51793	760 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	AP3M2	P53677	418 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RBP5	P82980	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	BFSP1	Q12934	665 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PAK1	Q13153	545 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SV2C	Q496J9	727 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NELFB	Q8WX92	580 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CASP10	Q92851	521 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887		H7C4K7	107 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	IKBKB	O14920	756 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	OAZ2	O95190	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CYP11A1	P05108	521 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ODC1	P11926	461 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	EPCAM	P16422	314 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KLRC2	P26717	231 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	VAMP7	P51809	220 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DLG4	P78352	724 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF280D	Q6N043	979 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	USP37	Q86T82	979 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TSC2	P49815	1807 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ADAM12	O43184	909 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GLUD1	P00367	558 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KRT19	P08727	400 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KRT13	P13646	458 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KCNA5	P22460	613 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NLRP12	P59046	1061 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TFF2	Q03403	129 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MYO1E	Q12965	1108 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RAB33A	Q14088	237 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ZACN	Q401N2	412 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	LILRA6	Q6PI73	481 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MED15	Q96RN5	788 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77

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