RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469535.5

CD46-212, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD46, Length 7,826 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-212ENST00000469535 ATP1A3P13637 1013 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 VCAM1P19320 739 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 CDC25BP30305 580 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 ADCY2Q08462 1091 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 NNTQ13423 1086 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 SPARCL1Q14515 664 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 VSTM4Q8IW00 320 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 PTPRN2Q92932 1015 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.4□□□□□ -1.22
CD46-212ENST00000469535 NCK2O43639 380 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 APOA4P06727 396 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 SCP2P22307 547 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 CLCN3P51790 818 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 STARD3Q14849 445 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 RASIP1Q5U651 963 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.236e-6■■□□□ 11.7
CD46-212ENST00000469535 REEP2Q9BRK0 252 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PYGBP11216 843 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 AKT1S1Q96B36 256 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 AGPAT1Q99943 283 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ING2Q9H160 280 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZFATQ9P243 1243 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 DPP7Q9UHL4 492 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.4□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 MFAP3LO75121 409 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 POMCP01189 267 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 SOX11P35716 441 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 RNF14Q9UBS8 474 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 AP1G2O75843 785 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ALDH2P05091 517 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 GUCY1A2P33402 732 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 DPYDQ12882 1025 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 JADE3Q92613 823 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 HEATR9A2RTY3 570 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 VCLP18206 1134 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NRBF2Q96F24 287 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PLAAQ9Y263 795 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 LGALS16A8MUM7 142 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 MAPK13O15264 365 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PSMD3O43242 534 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 APRTP07741 180 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ACADSBP45954 432 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZNF614Q8N883 585 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 MROH8Q9H579 483 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 CAND2O75155 1236 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PDHBP11177 359 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 DAB2P98082 770 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 CYB561D2O14569 222 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NPEPPSP55786 919 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.39□□□□□ -1.23
CD46-212ENST00000469535 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms