RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, human

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSB-208	ENST00000468600	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TP73	O15350	636 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	GPR39	O43194	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	HSD3B2	P26439	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CTXN1	P60606	82 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ERVK-21	P61565	698 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PRKD3	O94806	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	HAUS5	O94927	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PRR35	P0CG20	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	FCER1A	P12319	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	AGXT	P21549	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CREM	Q03060	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	OSM	P13725	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	FHL1	Q13642	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PTPRR	Q15256	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KCNA2	P16389	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KEL	P23276	732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SLC6A4	P31645	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ETFDH	Q16134	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	AOX1	Q06278	1338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	LINC00473	A8K010	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	SGTA	O43765	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	GATA3	P23771	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSB-208	ENST00000468600	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms