RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	LRG1	P02750	347 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	NBL1	P41271	181 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ACOT2	P49753	483 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	EPHA5	P54756	1037 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	LILRA4	P59901	499 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MTSS1L	Q765P7	747 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CD302	Q8IX05	232 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SNX21	Q969T3	373 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM209	Q96SK2	561 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	KXD1	Q9BQD3	176 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC3	Q9BY71	257 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ASB7	Q9H672	318 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	NCAN	O14594	1321 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ECI2	O75521	394 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MICAL2	O94851	1124 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	GLUL	P15104	373 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	GAP43	P17677	238 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PTPN2	P17706	415 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TYMP	P19971	482 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ELF1	P32519	619 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	STARD6	P59095	220 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TWF1	Q12792	350 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	E2F4	Q16254	413 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAL	Q6DHV7	355 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	GDE1	Q9NZC3	331 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	YIPF1	Q9Y548	306 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CYP11A1	P05108	521 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CPB1	P15086	417 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TXLNA	P40222	546 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR17	Q13304	367 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TMC8	Q8IU68	726 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIP11	Q15643	1979 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MTMR11	A4FU01	709 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRN2	O75325	713 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PAX3	P23760	479 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	STAT6	P42226	847 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ANGPT1	Q15389	498 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	ASB16	Q96NS5	453 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PTPRF-211	ENST00000467464	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12.96	□□□□□ -0.33

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