RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF286BP0CG31 522 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MYBL1P10243 752 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TNNI1P19237 187 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 COMTP21964 271 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MMP8P22894 467 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3CAP42336 1068 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PAFAH1B1P43034 410 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PTGIRP43119 386 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PHKA2P46019 1235 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6CP51160 858 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 BPIFB4P59827 614 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MYL6P60660 151 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K5Q13163 448 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TFDP1Q14186 410 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TRADDQ15628 312 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TAF3Q5VWG9 929 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf74Q6P047 294 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 EMBQ6PCB8 327 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF410Q86VK4 478 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 IQCKQ8N0W5 287 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 WHAMMQ8TF30 809 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TAF4BQ92750 862 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO2A1Q92959 643 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FNBP1Q96RU3 617 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SH3GL2Q99962 352 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM7Q9C029 511 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SDCBP2Q9H190 292 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 48.1
PTPRC-210ENST00000462363 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC66A2RUB6 948 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FSCN2O14926 492 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TP73O15350 636 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CEP104O60308 925 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GPR32O75388 356 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PROSCO94903 275 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NFICP08651 508 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC10A3P09131 477 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM153BP0C7A2 387 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL8P10145 99 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RRM1P23921 792 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CTGFP29279 349 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MAN1A1P33908 653 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GRM5P41594 1212 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 EPHB4P54760 987 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TNNC1P63316 161 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A5Q01650 507 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 INCA1Q0VD86 236 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TERF2Q15554 542 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB6Q15916 424 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GRIK4Q16099 956 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM153CQ494X1 144 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 XKR4Q5GH76 650 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 WDR44Q5JSH3 913 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC181Q5TID7 509 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 WDR78Q5VTH9 848 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DUPD1Q68J44 220 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.03□□□□□ -1.44
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