RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAND2P61296 217 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABPAQ06546 454 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPIL2Q13356 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCL15Q16663 113 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERO1BQ86YB8 467 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf31Q8N865 590 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO3Q9BYT9 981 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAPBQ9H115 298 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPCSQ9HAB8 311 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF186Q9NXI6 227 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCEA3O75764 348 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNAT2P19087 354 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC6A11P48066 632 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPP2Q13103 211 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP4Q13115 394 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERAP2Q6P179 960 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP45Q70EL2 814 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASB11Q8WXH4 323 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP53INP1Q96A56 240 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASIC4Q96FT7 647 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAML3Q96JK9 1138 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EDARQ9UNE0 448 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMB1P07942 1786 aa9.71□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.71□□□□□ -0.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BML4 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC27A2O14975 620 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRDCO43847 1150 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TADA3O75528 432 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGAP02671 866 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDCP20941 246 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUCY1A2P33402 732 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LBX1P52954 281 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTH1RQ03431 593 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPATQ06203 517 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPARAQ07869 468 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEPT2Q15019 361 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACER1Q8TDN7 264 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MVB12AQ96EY5 273 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTBD19C9JJ37 291 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM227AF5H4B4 570 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIP1O00291 1037 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DTNBO60941 627 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TM4SF4P48230 202 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGCS2P54868 508 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SREBF2Q12772 1141 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUSC3Q13454 348 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAPC2Q13487 334 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SBK1Q52WX2 424 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TREML2Q5T2D2 321 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAF1Q9H063 256 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PQ27 194 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms