RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453724.5

RPE-215, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 5

Gene RPE, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-215ENST00000453724 TTPALQ9BTX7 342 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CHST7Q9NS84 486 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FNIP2Q9P278 1114 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 HCSTQ9UBK5 93 aa6.71□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.71□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 USP34Q70CQ2 3546 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 M0QZQ0 153 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PIRO00625 290 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 PMM2O15305 246 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 AKAP3O75969 853 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ITGB3P05106 788 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CYP11A1P05108 521 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 TYMPP19971 482 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 PBX3P40426 434 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NDUFV1P49821 464 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 RBP5P82980 135 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CETN1Q12798 172 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TRPC3Q13507 836 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 COL19A1Q14993 1142 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PTPN14Q15678 1187 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 ZNF280DQ6N043 979 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DPH6Q7L8W6 267 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TAF4BQ92750 862 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 THAP9Q9H5L6 903 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 MAFFQ9ULX9 164 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 KPNA7A9QM74 516 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 P4HA2O15460 535 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 PHACTR2O75167 634 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FAM163BP0C2L3 166 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 MXI1P50539 228 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 METTL23Q86XA0 190 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPE-215ENST00000453724 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 EFHBQ8N7U6 833 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 RDH13Q8NBN7 331 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.69□□□□□ -1.34
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