RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 S1PR5Q9H228 398 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CASP4P49662 377 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ISM2Q6H9L7 571 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LILRA6Q6PI73 481 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CXorf38Q8TB03 319 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SENP8Q96LD8 212 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FNBP1Q96RU3 617 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CGRRF1Q99675 332 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AGAP1Q9UPQ3 857 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM50BQ9Y247 325 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDY1Q9Y6F8 540 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H7C4K7 107 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNNC2P02585 160 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31D3P0C874 917 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNNI1P19237 187 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NR2F2P24468 414 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR1D2P34982 312 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF560Q96MR9 790 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBC1D4O60343 1298 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB33AQ14088 237 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAMK4Q16566 473 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SV2CQ496J9 727 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP135Q66GS9 1140 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF280DQ6N043 979 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLEKHO2Q8TD55 490 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BORCS6Q96GS4 357 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SFXN1Q9H9B4 322 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIX4Q9UIU6 781 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT19P08727 400 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ODC1P11926 461 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TYMPP19971 482 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PNPLA4P41247 253 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBP5P82980 135 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTXN3Q4LDR2 81 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADSSL1Q8N142 457 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HDAC7Q8WUI4 952 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPP7Q9UHL4 492 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXL5Q9UKA1 691 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KPNA7A9QM74 516 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL13P26373 211 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MORC3Q14149 939 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CENPPQ6IPU0 288 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP37Q86T82 979 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KREMEN2Q8NCW0 462 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PARD3BQ8TEW8 1205 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUSD6Q92537 303 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAM7Q9H2U9 754 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXW11Q9UKB1 542 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C2orf16Q68DN1 1984 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BIN1O00499 593 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OAZ2O95190 189 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BMP6P22004 513 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ROR1Q01973 937 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITIH3Q06033 890 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAM9Q13443 819 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF516Q92618 1163 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDH22Q9UJ99 828 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGEF37A1IGU5 675 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLL1O00548 723 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYB561D2O14569 222 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAPK13O15264 365 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AKAP3O75969 853 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP11A1P05108 521 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VCANP13611 3396 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BFSP1Q12934 665 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CES5AQ6NT32 575 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMC5Q6UXY8 1006 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms