RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP8B2P98198 1209 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRNDQ07001 517 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CTBP1Q13363 440 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC12A1Q13621 1099 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE3CQ15386 1083 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP58Q5T655 872 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 KANK2Q63ZY3 851 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 HAUS3Q68CZ6 603 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF43Q68DV7 783 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TEPPQ6URK8 271 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 YAF2Q8IY57 180 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 OR7D4Q8NG98 312 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF480Q8WV37 535 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 COG8Q96MW5 612 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM140Q9NV12 185 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.32□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 B4DLN1 442 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 FCHO1O14526 889 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TOR1BO14657 336 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNQ3O43525 872 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR32O75388 356 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTL6BO94805 426 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 MATN4O95460 622 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 A1BGP04217 495 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CYBBP04839 570 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 DBHP09172 617 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 IL1R2P27930 398 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL4AP40617 200 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 STAT1P42224 750 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 NPTX2P47972 431 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CCR5P51681 352 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ANTXR2P58335 489 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 AP2B1P63010 937 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBED6P86452 979 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 MTM1Q13496 603 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CUL4BQ13620 913 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 STILQ15468 1287 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF11Q15544 211 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 VASNQ6EMK4 673 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 USP49Q70CQ1 688 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PROSER1Q86XN7 944 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT73Q86Y46 540 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ST8SIA4Q92187 359 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 NELL1Q92832 810 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 AHCYL1O43865 530 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM63AO94886 807 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF15O94989 841 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CD1AP06126 327 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 GNAI3P08754 354 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 NPPBP16860 134 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ALOX12P18054 663 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 EGR1P18146 543 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCY1A2P33402 732 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC24CP53992 1094 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAA2P54646 552 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 GNAI1P63096 354 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 IL13RA1P78552 427 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CD83Q01151 205 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ROR1Q01973 937 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 RINLQ6ZS11 566 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 BBS12Q6ZW61 710 aa5.3□□□□□ -1.56
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms