RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 CLCNKBP51801 687 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.53□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 CDT1Q9H211 546 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 DOCK6Q96HP0 2047 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa13.49□□□□□ -0.25
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