RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 AP3M2P53677 418 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ZACNQ401N2 412 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NSMFQ6X4W1 530 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MIEF2Q96C03 454 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PITPNM3Q9BZ71 974 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PARVAQ9NVD7 372 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.87■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CNTNAP1P78357 1384 aa17.87■□□□□ 0.45
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HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 LDHAP00338 332 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 RALAP11233 206 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 C1QTNF8P60827 252 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PGM5Q15124 567 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PDK4Q16654 411 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SLFN12LQ6IEE8 588 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 16.5
HCLS1-202ENST00000428394 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 COL20A1Q9P218 1284 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 UTRNP46939 3433 aa17.86■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 RASA4BC9J798 803 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 RASA4O43374 803 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 STAM2O75886 525 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NOMO3P69849 1222 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SNX1Q13596 522 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 DLGAP5Q15398 846 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NLRX1Q86UT6 975 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 FITM2Q8N6M3 262 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SAAL1Q96ER3 474 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CDHR1Q96JP9 859 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 VPS33BQ9H267 617 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CEP83Q9Y592 693 aa17.85■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 LIASO43766 372 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ANP32DO95626 131 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CALB1P05937 261 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 KCNJ2P63252 427 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SPP2Q13103 211 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MAMLD1Q13495 774 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MPP2Q14168 576 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC14Q15048 493 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 E2F5Q15329 346 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 IL31RAQ8NI17 732 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 MGARPQ8TDB4 240 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 AGAP11Q8TF27 550 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SAR1AQ9NR31 198 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.84■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ABLIM1O14639 778 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ALOX15BO15296 676 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ZWINTO95229 277 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ITGAVP06756 1048 aa17.83■□□□□ 0.45
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HCLS1-202ENST00000428394 PHBP35232 272 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 GRM1Q13255 1194 aa17.83■□□□□ 0.45
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HCLS1-202ENST00000428394 UGCGQ16739 394 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CENPUQ71F23 418 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 CPNE8Q86YQ8 564 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ALLCQ8N6M5 410 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 NSMCE1Q8WV22 266 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 FNBP1Q96RU3 617 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 SMC6Q96SB8 1091 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 GMLQ99445 158 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 PCDH9Q9HC56 1237 aa17.83■□□□□ 0.45
HCLS1-202ENST00000428394 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
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