RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 WRNIP1Q96S55 665 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF28PB7ZC32 967 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC4O43929 436 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL2O95198 593 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CCND1P24385 295 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP93Q8N1F7 819 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KA4O75676 772 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM107AO95990 144 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TPI1P60174 286 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCK1Q86TW2 530 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINI2O75830 405 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2ADP20671 130 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE3AQ05086 875 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KYNUQ16719 465 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PLD3Q8IV08 490 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RGL1Q9NZL6 768 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLPP1O60346 1717 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM120BA0PK00 339 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R3G1 203 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG6O75602 509 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF149Q8NC42 400 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SATB2Q9UPW6 733 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DPYSL4O14531 572 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MTFR1Q15390 333 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 STILQ15468 1287 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RBBP7Q16576 425 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HPS3Q969F9 1004 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AIM2O14862 343 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TLR2O60603 784 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC24CP53992 1094 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 JAMLQ86YT9 394 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MICU2Q8IYU8 434 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM245Q9H330 911 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAD9Q9H845 621 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PALLDQ8WX93 1383 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DFFAO00273 331 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB3P29508 390 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 17
EFTUD2-202ENST00000426333 NAB2Q15742 525 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SCFD2Q8WU76 684 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms