RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 AZI2Q9H6S1 392 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 KRT10P13645 584 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 ZACNQ401N2 412 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.13■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MYPNQ86TC9 1320 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CYP1A2P05177 515 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 KRT19P08727 400 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 IFNAR2P48551 515 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TAS2R40P59535 323 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 KRT17Q04695 432 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 DENND2CQ68D51 928 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MGARPQ8TDB4 240 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CDHR1Q96JP9 859 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MAFGO15525 162 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CD101Q93033 1021 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PORCNQ9H237 461 aa22.12■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 B4GALT5O43286 388 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RALAP11233 206 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 GARTP22102 1010 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 NCOA4Q13772 614 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SKOR1P84550 965 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CUL2Q13617 745 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 QPCTQ16769 361 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CHRNA3P32297 505 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MYL6P60660 151 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 LONRF1Q17RB8 773 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RNF19AQ9NV58 838 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.11■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PIK3R2O00459 728 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CHKAP35790 457 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RAP1GAPP47736 663 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CLCN3P51790 818 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 Q3C1V9 767 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RDM1Q8NG50 284 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 GTF2H1P32780 548 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TBK1Q9UHD2 729 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CSADQ9Y600 493 aa22.1■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TMEM192Q8IY95 271 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MAPK13O15264 365 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 ECEL1O95672 775 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 FDX1P10109 184 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CD302Q8IX05 232 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 NOD2Q9HC29 1040 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 GINS2Q9Y248 185 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 GCNT1Q02742 428 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 MTMR3Q13615 1198 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 PSMD6Q15008 389 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 LRRC14Q15048 493 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.09■■□□□ 1.13
SPRN-201ENST00000414069 CD19P15391 556 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms