RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 PLA2G4BP0C869 781 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 LRPAP1P30533 357 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ELF1P32519 619 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 NCKAP1LP55160 1127 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TEAD2Q15562 447 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF280DQ6N043 979 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZPBP2Q6X784 338 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCD2Q92925 531 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 FIZ1Q96SL8 496 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 YIPF1Q9Y548 306 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.49□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TISP43B9A030 160 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 KINO60870 393 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SOAT2O75908 522 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ADRB2P07550 413 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 MYL4P12829 197 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 GDI1P31150 447 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DNASE1L2Q92874 299 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 KCNN1Q92952 543 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 REEP2Q9BRK0 252 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 RAB34Q9BZG1 259 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 EPC1Q9H2F5 836 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CHRDQ9H2X0 955 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 BRD9Q9H8M2 597 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 STK24Q9Y6E0 443 aa14.48□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CLDN3O15551 220 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CPB1P15086 417 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SOX9P48436 509 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DMWDQ09019 674 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 STRN3Q13033 797 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DUSP4Q13115 394 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 GAREM2Q75VX8 874 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 APPL2Q8NEU8 664 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 KIF12Q96FN5 646 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 HINFPQ9BQA5 517 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TIPINQ9BVW5 301 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TSC2P49815 1807 aa14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 MYH11P35749 1972 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 A0A1W2PRU2 124 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF197O14709 1029 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 NFICP08651 508 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CLTAP09496 248 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CHRNB1P11230 501 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PSMC3P17980 439 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 MAGEA9P43362 315 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF131P52739 623 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 MCTP1Q6DN14 999 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CENPPQ6IPU0 288 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 NELL2Q99435 816 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CNGA3-202ENST00000393503 MTMR11A4FU01 709 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 PIGRP01833 764 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 CYP3A5P20815 502 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 SATB1Q01826 763 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 GPR17Q13304 367 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 FAM3CQ92520 227 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 TMX3Q96JJ7 454 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.45□□□□□ -0.1
CNGA3-202ENST00000393503 ASAH2Q9NR71 780 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms