RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 JAG2Q9Y219 1238 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CENPXA8MT69 81 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 VWA5AO00534 786 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RHOBTB3O94955 611 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZBED1O96006 694 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 BMP3P12645 472 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3CGP48736 1102 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NCKAP1LP55160 1127 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PTK6Q13882 451 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NR1I3Q14994 352 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 INSCQ1MX18 579 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NEK5Q6P3R8 708 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 XKRXQ6PP77 449 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RASSF3Q86WH2 238 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PNMA1Q8ND90 353 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 AP3S1Q92572 193 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 HHATLQ9HCP6 504 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PLK2Q9NYY3 685 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ASB14A6NK59 587 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF263O14978 683 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 NPTXRO95502 500 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PLS3P13797 630 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 SCNN1DP51172 638 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 BCAP31P51572 246 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 OLR1P78380 273 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SDE2Q6IQ49 451 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 GJD3Q8N144 294 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RDH13Q8NBN7 331 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD6Q8NC69 237 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 HDAC11Q96DB2 347 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 GSAPA4D1B5 854 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 K7ENM7 598 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC166P0CW27 439 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 TNNI1P19237 187 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 SOX5P35711 763 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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