RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRJQ12913 1337 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 GH1P01241 217 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ALADP13716 330 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TNNI1P19237 187 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 GNA15P30679 374 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 STX2P32856 288 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 VPS41P49754 854 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ACVR2BQ13705 512 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 C2CD6Q53TS8 623 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RNF43Q68DV7 783 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL6Q8N841 843 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MAML1Q92585 1016 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CDHR1Q96JP9 859 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RGS20O76081 388 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CLTAP09496 248 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CETN2P41208 172 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SLC18A1P54219 525 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC142Q17RM4 750 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PARVAQ9NVD7 372 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LIASO43766 372 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CFHP08603 1231 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEA4P43358 317 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 COPS2P61201 443 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MCL1Q07820 350 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.425e-6■■□□□ 14.3
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HOXD1-201ENST00000331462 MTFR1Q15390 333 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 XKR3Q5GH77 459 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC38Q5VT99 294 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CGB2Q6NT52 195 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TTC25Q96NG3 672 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
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HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.89■■□□□ 1.42
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HOXD1-201ENST00000331462 PTPN7P35236 360 aa23.89■■□□□ 1.42
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HOXD1-201ENST00000331462 MTMR2Q13614 643 aa23.89■■□□□ 1.42
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HOXD1-201ENST00000331462 CEP57Q86XR8 500 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 REPS2Q8NFH8 660 aa23.89■■□□□ 1.42
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HOXD1-201ENST00000331462 C9orf72Q96LT7 481 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CGRRF1Q99675 332 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GUA9 196 aa23.89■■□□□ 1.41
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HOXD1-201ENST00000331462 OAZ1P54368 228 aa23.89■■□□□ 1.41
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HOXD1-201ENST00000331462 EMC2Q15006 297 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 P3H1Q32P28 736 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM270Q6UE05 265 aa23.89■■□□□ 1.41
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HOXD1-201ENST00000331462 ATG4CQ96DT6 458 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEB2O15479 319 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 CD58P19256 250 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 TAC1P20366 129 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 MMP8P22894 467 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 PASD1Q8IV76 773 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 TCP11Q8WWU5 503 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD1-201ENST00000331462 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.88■■□□□ 1.41
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