RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PODXLO00592 558 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 JAM2P57087 298 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASIC2Q16515 512 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TOP1MTQ969P6 601 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FERP16591 822 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SHC3Q92529 594 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ASPAP45381 313 aa29.38■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1G1P47890 313 aa29.36■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MEA1Q16626 185 aa29.36■■■□□ 2.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BPIFB4P59827 614 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK17Q00537 523 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR59Q6PJI9 974 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 YME1L1Q96TA2 773 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.34■■■□□ 2.29
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