RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314121.8

ZNF541-202, Transcript of zinc finger protein 541, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ZNF541, Length 4,631 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541-202ENST00000314121 PID1Q7Z2X4 250 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SUN2Q9UH99 717 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MGEA5O60502 916 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PRKCBP05771 671 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CYP11B1P15538 503 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TMED1Q13445 227 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 RSAD1Q9HA92 442 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ADA2Q9NZK5 511 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TTC36A6NLP5 189 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 GHRP10912 638 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CUL3Q13618 768 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KIF19Q2TAC6 998 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 LRRC43Q8N309 656 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 NSL1Q96IY1 281 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TBX20Q9UMR3 447 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PSTPIP1O43586 416 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 EXTL3O43909 919 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 WEE2P0C1S8 567 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ERFP50548 548 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 AP1B1Q10567 949 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 EFHC2Q5JST6 749 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PACS2Q86VP3 889 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MAGEB18Q96M61 343 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 THTPAQ9BU02 230 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 H3BRJ5 948 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 RPS6KA5O75582 802 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CRYMQ14894 314 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SLC35C1Q96A29 364 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ANP32DO95626 131 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KRT4P19013 534 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SLC12A1Q13621 1099 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 STILQ15468 1287 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TMEM139Q8IV31 216 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 FAM151AQ8WW52 585 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ENO4A6NNW6 628 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 A8MXQ7 604 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 UBOX5O94941 541 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KCNMA1Q12791 1236 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 Q3C1V9 767 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ATP8B3O60423 1300 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PIK3R2O00459 728 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CYTH3O43739 400 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KLRC4O43908 158 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KLHL2O95198 593 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 IL1RL1Q01638 556 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 AMPD2Q01433 879 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 Q4G0T1 1027 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 RDM1Q8NG50 284 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KCNK16Q96T55 309 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 F5H423 210 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 KCNA3P22001 575 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 PRKCEQ02156 737 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 POU5F1BQ06416 359 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF541-202ENST00000314121 MTM1Q13496 603 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms