RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ZACNQ401N2 412 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SV2CQ496J9 727 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SUSD3Q96L08 255 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TTPALQ9BTX7 342 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TSC2P49815 1807 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA7A9QM74 516 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 FSCN2O14926 492 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MYO1EQ12965 1108 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 RTP2Q5QGT7 225 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35C1Q96A29 364 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 HPDLQ96IR7 371 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CHST7Q9NS84 486 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 HIDE1A8MVS5 230 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 GTF2H1P32780 548 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MXI1P50539 228 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MYL5Q02045 173 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 NCOA4Q13772 614 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SENP8Q96LD8 212 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 M0QZQ0 153 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 VNN1O95497 513 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 FGFR3P22607 806 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PAX3P23760 479 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3CAP42336 1068 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MYL6P60660 151 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 DSG1Q02413 1049 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN14Q15678 1187 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 KRT39Q6A163 491 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SYN3O14994 580 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CYB561D2O14569 222 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 HLA-DRAP01903 254 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ODC1P11926 461 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF165P49910 485 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CBWD6Q4V339 395 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 APPL2Q8NEU8 664 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 FANCLQ9NW38 375 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 IRAK3Q9Y616 596 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ATICP31939 592 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD5Q16401 504 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF699Q32M78 642 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ18B7U540 433 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PER2O15055 1255 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 FMO5P49326 533 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH2Q12809 1159 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ12Q14500 433 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 WDR72Q3MJ13 1102 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PDXDC1Q6P996 788 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 ANKS3Q6ZW76 656 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 XYLT2Q9H1B5 865 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 TLE6Q9H808 572 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 GDAP2Q9NXN4 497 aa24■■□□□ 1.43
HOXD4-201ENST00000306324 PLXNA3P51805 1871 aa24■■□□□ 1.43
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