RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 STILQ15468 1287 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F8A0AVK6 867 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC78A2IDD5 438 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXW4P57775 412 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 USP33Q8TEY7 942 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 OTULINQ96BN8 352 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ITM2BQ9Y287 266 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G4AP47712 749 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KCND2Q9NZV8 630 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 PAK5Q9P286 719 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B3P37058 310 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf10Q5SRN2 563 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S6Q9UL45 172 aa25.31■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT8P05787 483 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 FDX1P10109 184 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A5P33763 92 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF543Q08ER8 600 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYAQ5MJ70 313 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 USP49Q70CQ1 688 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG6Q9Y672 507 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 DGAT1O75907 488 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC29A2Q14542 456 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MDM1Q8TC05 714 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKS1AQ92625 1134 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM143Q96AN5 459 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1GB0I1T2 1018 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX3O15119 743 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT16P08779 473 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 COILP38432 576 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 STAT5BP51692 787 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KIZQ2M2Z5 673 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT35Q92764 455 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRC1P26715 233 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRP35270 261 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F7Q96AV8 911 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.3■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 BLVRAP53004 296 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MFN1Q8IWA4 741 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 NOD2Q9HC29 1040 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TFR2Q9UP52 801 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CPB1P15086 417 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX5P17844 614 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB3P29508 390 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CHI3L2Q15782 390 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB14O75071 495 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 RBP5P82980 135 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 APPL2Q8NEU8 664 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT7Q99832 543 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAPO00193 183 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIK1P39086 918 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNEQ86WN2 208 aa25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 VHLP40337 213 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE3AQ05086 875 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 GRID1Q9ULK0 1009 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 DGKIO75912 1065 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ1P48048 391 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ANTXR2P58335 489 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 REREQ9P2R6 1566 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD51Q06609 339 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM60Q495X7 471 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA18Q8TC71 538 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM162AQ96A26 154 aa25.28■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MED15Q96RN5 788 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms