RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 RFC2P35250 354 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PNPLA4P41247 253 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 BCO2Q9BYV7 579 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PIRO00625 290 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LRPAP1P30533 357 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNC1P63316 161 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SPA17Q15506 151 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 POLIQ9UNA4 740 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ENPP3O14638 875 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PPEF2O14830 753 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 INPPL1O15357 1258 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LCA5LO95447 670 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CLCN1P35523 988 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE6CP51160 858 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT83P78385 493 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIK3Q13003 919 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 NAB2Q15742 525 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM270Q6UE05 265 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 UBR7Q8N806 425 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CISHQ9NSE2 258 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 MIOSQ9NXC5 875 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 USP27XA6NNY8 438 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0355O15063 1070 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMP1P01033 207 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 WEE2P0C1S8 567 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CD58P19256 250 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 BPIFB4P59827 614 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC18A3Q16572 532 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 POMCP01189 267 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP11B1P15538 503 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF6P49848 677 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 RAG1P15918 1043 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TCTN1Q2MV58 587 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SV2CQ496J9 727 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 MMS19Q96T76 1030 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT11Q9BT88 431 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC3P53804 2025 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087X0T9 212 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM228BP0C875 321 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP27A1Q02318 531 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC39CQ8N584 583 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 URGCPQ8TCY9 931 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 AGPAT1Q99943 283 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF263O14978 683 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 FGFR1P11362 822 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 RAP1GAPP47736 663 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF132P52740 706 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 IKBKEQ14164 716 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 ACP6Q9NPH0 428 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-201ENST00000298838 KPNA7A9QM74 516 aa22.15■■□□□ 1.14
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