RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 CFHP08603 1231 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 C8orf74Q6P047 294 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 KRT12Q99456 494 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CREBZFQ9NS37 354 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RNF19AQ9NV58 838 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 IL18RAPO95256 599 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RARBP10826 455 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CD58P19256 250 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 HOXC8P31273 242 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CASP8Q14790 479 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 TCEAL1Q15170 157 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 HDXQ7Z353 690 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SNX17Q15036 470 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 BTBD6Q96KE9 485 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 POLIQ9UNA4 740 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 WEE2P0C1S8 567 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SNTG2Q9NY99 539 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 STIM2Q9P246 746 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ALG6Q9Y672 507 aa22.81■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ADAMTS4O75173 837 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GLI1P08151 1106 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ZNF699Q32M78 642 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 WNT8BQ93098 351 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ZNF653Q96CK0 615 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 FAM81BQ96LP2 452 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ACAP3Q96P50 834 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ITGB3P05106 788 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CYP1A2P05177 515 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MCM3P25205 808 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ZNF394Q53GI3 561 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 UBR7Q8N806 425 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ALG3Q92685 438 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ITGA4P13612 1032 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MARCKSL1P49006 195 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 APLP1P51693 650 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CXorf38Q8TB03 319 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 KRT35Q92764 455 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NUP85Q9BW27 656 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 H3BQF6 201 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RAP1GAPP47736 663 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MESDQ14696 234 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 PASD1Q8IV76 773 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.79■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 MTA2O94776 668 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ASPAP45381 313 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 CDC42EP1Q00587 391 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 C2CD6Q53TS8 623 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SPC25Q9HBM1 224 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 SRRDQ9UH36 339 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ESYT3A0FGR9 886 aa22.77■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 RAD51CO43502 376 aa22.77■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 ASGR1P07306 291 aa22.77■■□□□ 1.24
SOX17-201ENST00000297316 GNA15P30679 374 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms