RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PARVGQ9HBI0 331 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FAM186AA6NE01 2351 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 BMP15O95972 392 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 OR4Q2P0C623 313 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MYL4P12829 197 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 GRM2Q14416 872 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 BRAPQ7Z569 592 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 USP37Q86T82 979 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 BEST2Q8NFU1 509 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 RAD54LQ92698 747 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ASB16Q96NS5 453 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 NELL2Q99435 816 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.32■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0B4J269 797 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 LAMTOR5O43504 91 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MOSPD3O75425 235 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ADRB2P07550 413 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 GJA1P17302 382 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 EPHA5P54756 1037 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 LEMD2Q8NC56 503 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 DNASE1L2Q92874 299 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 FAM212AQ96EL1 285 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 BRD9Q9H8M2 597 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ASAH2Q9NR71 780 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 YIPF1Q9Y548 306 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 PATJQ8NI35 1801 aa21.31■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 PPEF2O14830 753 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 NCAM2O15394 837 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 VNN2O95498 520 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEA9P43362 315 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA1Q5VX52 437 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 JADE1Q6IE81 842 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCD2Q92925 531 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 FIZ1Q96SL8 496 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 OR6C75A6NL08 312 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2BQ00403 316 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 GPR17Q13304 367 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 VITQ6UXI7 678 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CD302Q8IX05 232 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN23Q96B33 292 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.29■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SHISA7A6NL88 538 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 PSMC3P17980 439 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TYMPP19971 482 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ABCD1P33897 745 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 VIPR2P41587 438 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ID4P47928 161 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 LILRA4P59901 499 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 DUSP4Q13115 394 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 PLD1Q13393 1074 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TEAD2Q15562 447 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 IRF7Q92985 503 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.28■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 KINO60870 393 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 NFICP08651 508 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ODC1P11926 461 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 GDI1P31150 447 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 DDIT3P35638 169 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 ACOT2P49753 483 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 EPHB3P54753 998 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 FZD5Q13467 585 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 MYBPC2Q14324 1141 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.27■■□□□ 1
CXCL3-201ENST00000296026 CENPPQ6IPU0 288 aa21.27■■□□□ 1
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