RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295992.7

PCOLCE2-201, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCOLCE2, Length 2,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2-201ENST00000295992 DNM1LO00429 736 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 RASGRF2O14827 1237 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MYBL1P10243 752 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PTK6Q13882 451 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PPP1R7Q15435 360 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCT6BQ92526 530 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 FAM84AQ96KN4 292 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHST7Q9NS84 486 aa24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 LCTP09848 1927 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MAFGO15525 162 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DGAT1O75907 488 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 NR3C2P08235 984 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SCP2P22307 547 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC1A1P43005 524 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CALCOCO2Q13137 446 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 GPR142Q7Z601 462 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MMP19Q99542 508 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.75■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ASAP2O43150 1006 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 RGS20O76081 388 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 GHRP10912 638 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CENPCQ03188 943 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PTP4A2Q12974 167 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM11Q96F44 468 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DCLK3Q9C098 648 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 STRNO43815 780 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ITIH2P19823 946 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 RRM1P23921 792 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 KCTD2Q14681 263 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PSMD6Q15008 389 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MON1BQ7L1V2 547 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 KCNN1Q92952 543 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CEP89Q96ST8 783 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.74■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 EXTL3O43909 919 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 MAN1A1P33908 653 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHKAP35790 457 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLCO1A2P46721 670 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZACNQ401N2 412 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 NFASCO94856 1347 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 WNT7BP56706 349 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CNGA2Q16280 664 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SNF8Q96H20 258 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.73■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PSAPP07602 524 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SP3Q02447 781 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SNX1Q13596 522 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 LLGL1Q15334 1064 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 WBP1LQ9NX94 342 aa24.72■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PROSCO94903 275 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 HLA-DRAP01903 254 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CTGFP29279 349 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCDC25Q86WR0 208 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 GPR25O00155 361 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 PGK2P07205 417 aa24.71■■□□□ 1.55
PCOLCE2-201ENST00000295992 SCTRP47872 440 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms