RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 THPOP40225 353 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 XKR4Q5GH76 650 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GLRA4Q5JXX5 417 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 APOL6Q9BWW8 343 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 COG5Q9UP83 839 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 NCK2O43639 380 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS6KA5O75582 802 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP1GAPP47736 663 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH8P55286 799 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 KLK14Q9P0G3 267 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 DERAQ9Y315 318 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PPEF2O14830 753 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GNA15P30679 374 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIFB4P59827 614 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF677Q86XU0 584 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 RFFLQ8WZ73 363 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 HPDLQ96IR7 371 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQY0 241 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 FTCDO95954 541 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ATICP31939 592 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PTK7Q13308 1070 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF6Q15052 776 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF394Q53GI3 561 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX12Q9UMY4 172 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF185O15231 689 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 WHAMMQ8TF30 809 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TADA3O75528 432 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 RBP5P82980 135 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TFAP2BQ92481 460 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNE1P15382 129 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBB2AQ13885 445 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 COG1Q8WTW3 980 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TWNKQ96RR1 684 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.811e-17■■■□□ 18.8
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PARP2Q9UGN5 583 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PADI3Q9ULW8 664 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 MGEA5O60502 916 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GHRP10912 638 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PRLRP16471 622 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 CD52P31358 61 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GPC5P78333 572 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 LPIN1Q14693 890 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEAL1Q15170 157 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM26DQ5JW98 314 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 PASD1Q8IV76 773 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms