RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283249.6

ITGB6-201, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB6, Length 4,675 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-201ENST00000283249 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SPATA18Q8TC71 538 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 KRT35Q92764 455 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TMEM247A6NEH6 219 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ATP9BO43861 1147 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 FSBPO95073 299 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ATP6V1G2O95670 118 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PDHBP11177 359 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RASA1P20936 1047 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 COPB2P35606 906 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PSMD7P51665 324 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NCOA4Q13772 614 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 IMPG1Q17R60 797 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NYAP2Q9P242 653 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PTPRUQ92729 1446 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 F8VZ95 297 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CYP11B2P19099 503 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DAB2P98082 770 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MAP3K10Q02779 954 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 KYAT1Q16773 422 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RNF135Q8IUD6 432 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DDIASQ8IXT1 998 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 COL15A1P39059 1388 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ALKQ9UM73 1620 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CPA2P48052 419 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NTRK3Q16288 839 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 XKR3Q5GH77 459 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 IFT43Q96FT9 208 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MCEEQ96PE7 176 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RIT2Q99578 217 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 BCS1LQ9Y276 419 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CES2O00748 559 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NEMP1O14524 444 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 KRT16P08779 473 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CALB2P22676 271 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PTPN4P29074 926 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ATICP31939 592 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MASTLQ96GX5 879 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 A8MXQ7 604 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PSMD3O43242 534 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PTENP60484 403 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GRB10Q13322 594 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CHI3L2Q15782 390 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MTMR8Q96EF0 704 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 FKBP6O75344 327 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 TLR10Q9BXR5 811 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ITGB6-201ENST00000283249 LZTS1Q9Y250 596 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms