RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.86■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PBX1P40424 430 aa22.86■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.86■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 RASSF10A6NK89 507 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 THTPAQ9BU02 230 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 KLC1Q07866 573 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ACAD11Q709F0 780 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 LPAR1Q92633 364 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 KIF12Q96FN5 646 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SPATA33Q96N06 139 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 AGAP3Q96P47 875 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 B2RBV5 119 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FAM86B1E9PN63 330 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 APOL1O14791 398 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 GDF3Q9NR23 364 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 BATF3Q9NR55 127 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SUFUQ9UMX1 484 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ZBTB39O15060 712 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 HUS1O60921 280 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 NME3Q13232 169 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.85■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ATP9BO43861 1147 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 MTMR9Q96QG7 549 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 TMEM51Q9NW97 253 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 BAG5Q9UL15 447 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PFDN6O15212 129 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 CASP5P51878 434 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 HIC1Q14526 733 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 HAO1Q9UJM8 370 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 CUL3Q13618 768 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 RASSF3Q86WH2 238 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.84■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 FUT2Q10981 343 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 STX3Q13277 289 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SLC5A5Q92911 643 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ADA2Q9NZK5 511 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 TNS2Q63HR2 1409 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 MAP3K6O95382 1288 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 GRIK5Q16478 980 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 LCA5Q86VQ0 697 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 METTL23Q86XA0 190 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 ASAP2O43150 1006 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 SHMT1P34896 483 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 RNF139Q8WU17 664 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 PIM2Q9P1W9 311 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.83■■□□□ 1.25
USP12-201ENST00000282344 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 KLC3Q6P597 504 aa22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 DNAJC9Q8WXX5 260 aa22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.83■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 CCDC78A2IDD5 438 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 PYGMP11217 842 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 NPTX2P47972 431 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TKFCQ3LXA3 575 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SV2AQ7L0J3 742 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 ZNF677Q86XU0 584 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 EXTL3O43909 919 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 PMLP29590 882 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SKOR1P84550 965 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 KIF19Q2TAC6 998 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 FAXCQ5TGI0 409 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 PGBD4Q96DM1 585 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 MTBPQ96DY7 904 aa22.82■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms