RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 TEX28O15482 410 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 TRAPPC3O43617 180 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ITGB3P05106 788 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 NDUFV1P49821 464 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 WDR49Q8IV35 697 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 GPR65Q8IYL9 337 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SIX4Q9UIU6 781 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.73■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 M0QZQ0 153 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 AKAP3O75969 853 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 LILRA4P59901 499 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 PSMD5Q16401 504 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ZNF516Q92618 1163 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 FNBP1Q96RU3 617 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 CLEC1BQ9P126 229 aa22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 SYN3O14994 580 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 EPCAMP16422 314 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 CCNE1P24864 410 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ADAM9Q13443 819 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.236e-10■■■■□ 24.6
COX5B-201ENST00000258424 FNIP2Q9P278 1114 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.71■■□□□ 1.23
COX5B-201ENST00000258424 PSMA7O14818 248 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 ADAM12O43184 909 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TNNC2P02585 160 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TNNI1P19237 187 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 KLRC2P26717 231 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CLCN4P51793 760 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DLG4P78352 724 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 STIM1Q13586 685 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 BORCS6Q96GS4 357 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 SENP8Q96LD8 212 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TSG101Q99816 390 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 MTRRQ9UBK8 725 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 FSD2A1L4K1 749 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 MAPK13O15264 365 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DCXO43602 365 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 ADH1AP07327 375 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 KRT19P08727 400 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R2P41236 205 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TAF6P49848 677 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 NELFBQ8WX92 580 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 FAM122AQ96E09 287 aa22.69■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 PRR33A8MZF0 331 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CLDN10P78369 228 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CREMQ03060 361 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 LRRC63Q05C16 580 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TTI2Q6NXR4 508 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 PDXDC1Q6P996 788 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 PALB2Q86YC2 1186 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 ZNF560Q96MR9 790 aa22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 CETN3O15182 167 aa22.67■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D4O60343 1298 aa22.67■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 MBD3O95983 291 aa22.67■■□□□ 1.22
COX5B-201ENST00000258424 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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