RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TSHRP16473 764 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GALCP54803 685 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HTR7P34969 479 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PPIL2Q13356 520 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CUL2Q13617 745 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CEP57Q86XR8 500 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KLHL29Q96CT2 875 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 VDRP11473 427 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GUCY2FP51841 1108 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HMGCS2P54868 508 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DNAJC3Q13217 504 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RNF149Q8NC42 400 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MTMR9Q96QG7 549 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EFCC1Q9HA90 598 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GSTA1P08263 222 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RARGP13631 454 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TGM2P21980 687 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 COL18A1P39060 1754 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ACTR2P61160 394 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SNCBQ16143 134 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CAVIN3Q969G5 261 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FAR2Q96K12 515 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 UROC1Q96N76 676 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NAB1Q13506 487 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NAA25Q14CX7 972 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ARMC3Q5W041 872 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FAF2Q96CS3 445 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ABCB6Q9NP58 842 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BATF3Q9NR55 127 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLC16A4O15374 487 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSEN1P49768 467 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TAF11Q15544 211 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MMEL1Q495T6 779 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 POTEAQ6S8J7 498 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ASB2Q96Q27 587 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PMM2O15305 246 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PON1P27169 355 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GIT2Q14161 759 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PGM5Q15124 567 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ACAD11Q709F0 780 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 WWP1Q9H0M0 922 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CHST12Q9NRB3 414 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 WNT10BO00744 389 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ODC1P11926 461 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 A8MXQ7 604 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MMEP08473 750 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FAM163BP0C2L3 166 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MCF2P10911 925 aa6.66□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 SLC12A3P55017 1021 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PRMT2P55345 433 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GTF2BQ00403 316 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCNG2Q16589 344 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRGUKQ96M69 825 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MYH10P35580 1976 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SMIM23A6NLE4 172 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GRB10Q13322 594 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MUM1Q2TAK8 710 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.66□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.66□□□□□ -1.34
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