RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044163.9

Cnot4-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnot4, Length 3,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot4-201ENSMUST00000044163 DpysQ9EQF5 519 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm27029A2A4P4 543 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm4841E9QAA8 417 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zfp715G3X9T1 886 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Usp35M0QWN7 1009 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Dpysl4O35098 572 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 VimP20152 466 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 St3gal1P54751 337 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Aars2Q14CH7 980 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zswim5Q80TC6 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Slitrk1Q810C1 696 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zfp120Q8BZW4 436 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tmem145Q8C4U2 746 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tph2Q8CGV2 488 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rassf9Q8K342 435 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Slf1Q8R3P9 1054 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pcdha3Q91Y16 942 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Sec14l2Q99J08 403 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Q99KU6 348 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rnf135Q9CWS1 417 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gpatch1Q9DBM1 930 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Nudt5Q9JKX6 218 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Fut2Q9JL27 347 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cpsf3Q9QXK7 684 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rgs17Q9QZB0 210 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Plod3Q9R0E1 741 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Lrrc63A6H694 637 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Apol7bB1AQP7 369 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Lrrc10bG3XA50 292 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Impa1O55023 277 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Aff1O88573 1216 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cyp2b9P12790 491 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Atf2P16951 487 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 PrkchP23298 683 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Stmn4P63042 189 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Apol7eQ3UZ24 369 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Abl2Q4JIM5 1182 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tom1l2Q5SRX1 507 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 FcgrtQ61559 365 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ddr2Q62371 854 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Dcaf15Q6PFH3 600 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 March4Q80TE3 409 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Impg2Q80XH2 1243 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Als2cr12Q8BVM7 383 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Trmt13Q8BYH3 481 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Fam118bQ8C569 351 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rpp40Q8R1F9 363 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ap3m2Q8R2R9 418 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tom1l1Q923U0 474 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Atp6v1e2Q9D593 226 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gpr37Q9QY42 600 aa6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Robo3Q9Z2I4 1366 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm3043K7N693 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm16440K7N6G6 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm2244L7N2A3 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm3278L7N2D2 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gm8271L7N2E2 218 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 C1qbpO35658 278 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Hoxc6P10629 235 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 FlgP11088 336 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 PrphP15331 475 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Bmp2P21274 394 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Lta4hP24527 611 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Scarf2P59222 833 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ptprn2P80560 1001 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pou6f1Q07916 301 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Arl14Q3SXC5 192 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pid1Q3UBG2 217 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cyp3a16Q64481 504 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Nlrp14Q6B966 993 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 C2cd2lQ80X80 706 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ankfy1Q810B6 1169 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ppme1Q8BVQ5 386 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mamdc2Q8CG85 686 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Uroc1Q8VC12 676 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mfsd5Q921Y4 450 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Foxp3Q99JB6 429 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Map4k3Q99JP0 894 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 4930550L24RikQ99PA7 320 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Prss23Q9D6X6 382 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Anxa9Q9JHQ0 345 aa6.59□□□□□ -1.35
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.8 ms