RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr220	E9Q050	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plekha5	E9Q6H8	1269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trove2	O08848	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Neurod4	O09105	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abcb1b	P06795	1276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ckm	P07310	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Akt1	P31750	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prim2	P33610	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gnat2	P50149	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp2c39	P56656	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Khk	P97328	298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tfb2m	Q3TL26	396 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Esrp1	Q3US41	680 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q3V0E1	1183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10488	Q4KL05	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Marco	Q60754	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc20a1	Q61609	681 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pacsin1	Q61644	441 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Srsf2	Q62093	221 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm14819	Q62478	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phc1	Q64028	1012 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptpdc1	Q6NZK8	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psd2	Q6P1I6	770 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tra2a	Q6PFR5	281 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Amph	Q7TQF7	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr761	Q7TRJ0	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mphosph10	Q810V0	681 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf3c4	Q8BMQ2	817 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrac	Q8BNX7	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Engase	Q8BX80	734 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iffo1	Q8BXL9	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scara3	Q8C850	606 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vcpip1	Q8CDG3	1220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d14	Q8CGA2	694 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erich5	Q8K0S2	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cgref1	Q8R1U2	281 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r14c	Q8R4S0	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rhoq	Q8R527	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Swsap1	Q8VCI7	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zgpat	Q8VDM1	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q91V76	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rev1	Q920Q2	1249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brap	Q99MP8	591 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cadm3	Q99N28	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf2ird2	Q99NI3	936 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tube1	Q9D6T1	475 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim39	Q9ESN2	488 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Msgn1	Q9JK54	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trem1	Q9JKE2	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Htra1	Q9R118	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dgke	Q9R1C6	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnik	P83510	1323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kdr	P35918	1367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iqsec2	Q5DU25	1478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fnd3c2	A2AP83	941 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	AU019823	E9PUQ3	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exoc4	O35382	975 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stam2	O88811	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Camk2a	P11798	478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lta4h	P24527	611 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Htr1b	P28334	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bdkrb2	P32299	392 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gdi1	P50396	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nol4	P60954	483 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fer	P70451	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psme2	P97372	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sec23a	Q01405	765 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ckb	Q04447	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4933415F23Rik	Q14BX6	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Micall2	Q3TN34	1009 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shcbp1l	Q3TTP0	639 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc2a13	Q3UHK1	637 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf10	Q3UIW5	804 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Parp3	Q3ULW8	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bahd1	Q497V6	772 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	B3gnt3	Q5JCS9	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	G2e3	Q5RJY2	716 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arnt2	Q61324	712 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grik5	Q61626	979 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adam20	Q7M763	760 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Celf4	Q7TSY6	486 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chst14	Q80V53	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bmp3	Q8BHE5	468 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mical2	Q8BML1	960 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem220	Q8BP07	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r3e	Q8BRJ4	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Svs3b	Q8BZH8	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sept10	Q8C650	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crbn	Q8C7D2	445 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krtcap3	Q8K177	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr799	Q8VGI7	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf24	Q91VN1	368 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp5c1	Q91VR2	298 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elmod3	Q91YP6	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fuca1	Q99LJ1	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Capn9	Q9D805	690 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dydc1	Q9D9T0	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shcbp1	Q9Z179	668 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bnip3l	Q9Z2F7	218 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc22a4	Q9Z306	553 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms