RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RALBP1	Q15311	655 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP47	Q96K76	1375 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CBX1	P83916	185 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NLRP13	Q86W25	1043 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KDM6B	O15054	1643 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PANK3	Q9H999	370 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDIT3	P35638	169 aa		11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TSC1	Q92574	1164 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KDM5C	P41229	1560 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INSR	P06213	1382 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGSF3	O75054	1194 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGF1R	P08069	1367 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MCM5	P33992	734 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694		E9PCH4	1651 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF521	Q96K83	1311 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694		E9PSI1	815 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BCAR3	O75815	825 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBSN	Q9H1K0	784 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.9	□□□□□ -0.66
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CUL7	Q14999	1698 aa		10.9	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTMS	P20962	102 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF445	P59923	1031 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67

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