RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637354.1

PTPRD-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRD, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-215ENST00000637354 SLF2Q8IX21 1173 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 C3orf80F5H4A9 247 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 GFRA3O60609 400 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 RNF40O75150 1001 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 PRR14Q9BWN1 585 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 GGCXP38435 758 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-215ENST00000637354 APLP1P51693 650 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRD-215ENST00000637354 PADI6Q6TGC4 694 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 BARGINQ6ZT62 677 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 ZNF516Q92618 1163 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 EYA1Q99502 592 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRD-215ENST00000637354 AK7Q96M32 723 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRD-215ENST00000637354 LCE2BO14633 110 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-215ENST00000637354 ZPR1O75312 459 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-215ENST00000637354 NUTM2FA1L443 756 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRD-215ENST00000637354 COPS2P61201 443 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-215ENST00000637354 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-215ENST00000637354 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRD-215ENST00000637354 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-215ENST00000637354 TRIM66O15016 1216 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-215ENST00000637354 GPR37O15354 613 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-215ENST00000637354 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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PTPRD-215ENST00000637354 C14orf37Q86TY3 774 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-215ENST00000637354 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRD-215ENST00000637354 IL27Q8NEV9 243 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 PRR20EP86478 221 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 PRR20CP86479 221 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 PRR20DP86480 221 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 PRR20AP86496 221 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 NR1I2O75469 434 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 HIC1Q14526 733 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 SPRYD7Q5W111 196 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 ZNF787Q6DD87 383 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 TLL1O43897 1013 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 ADH1BP00325 375 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRD-215ENST00000637354 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-215ENST00000637354 DGAT1O75907 488 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRD-215ENST00000637354 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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PTPRD-215ENST00000637354 S1PR4O95977 384 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-215ENST00000637354 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-215ENST00000637354 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRD-215ENST00000637354 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRD-215ENST00000637354 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRD-215ENST00000637354 FAM161AQ3B820 660 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRD-215ENST00000637354 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-215ENST00000637354 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-215ENST00000637354 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-215ENST00000637354 SPSB2Q99619 263 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-215ENST00000637354 FAM187AA6NFU0 413 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-215ENST00000637354 RPIAP49247 311 aa9.46□□□□□ -0.9
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