RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 LTKP29376 864 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLIT1O75093 1534 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXD1Q16676 465 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIK3C2BO00750 1634 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYNMO15061 1565 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 IDI1Q13907 227 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 EID1Q9Y6B2 187 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOS1P29475 1434 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 TET3O43151 1660 aa23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3-210ENST00000617904 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3-210ENST00000617904 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRB3O60242 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNA6P17658 529 aa23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 E9PCH4 1651 aa23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 STAC3Q96MF2 364 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRPM2O94759 1503 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM94Q12767 1356 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFYVE9O95405 1425 aa23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 NWD1Q149M9 1564 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCANQ96GW7 911 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGL3Q3MIN7 710 aa23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBX22Q9Y458 520 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLTCL1P53675 1640 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSH6P52701 1360 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF1BO60333 1816 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLAIN2Q9P270 581 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIP2AQ14689 1571 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIK3R4Q99570 1358 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRUQ92729 1446 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHLPP1O60346 1717 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYOM2P54296 1465 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP47Q96K76 1375 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 C14orf37Q86TY3 774 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAMC1P11047 1609 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 POTEAQ6S8J7 498 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 JCADQ9P266 1359 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC24A1O60721 1099 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATF3P18847 181 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3-210ENST00000617904 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 METP08581 1390 aa23.29■■□□□ 1.32
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