RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.62	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.6	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.6	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	IDI1	Q13907	227 aa		32.59	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.59	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
DGCR6-208	ENST00000608842	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.57	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	MLEC	Q14165	292 aa		32.57	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	ANP32C	O43423	234 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	TESK2	Q96S53	571 aa		32.51	■■■□□ 2.8
DGCR6-208	ENST00000608842	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.51	■■■□□ 2.79
DGCR6-208	ENST00000608842	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.49	■■■□□ 2.79
DGCR6-208	ENST00000608842	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.46	■■■□□ 2.79
DGCR6-208	ENST00000608842	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.44	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.43	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.43	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.42	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DGCR6-208	ENST00000608842	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	TMF1	P82094	1093 aa		32.3	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	C3	P01024	1663 aa		32.3	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.27	■■■□□ 2.76
DGCR6-208	ENST00000608842	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.24	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.24	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	TNR	Q92752	1358 aa		32.24	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	MYOM1	P52179	1685 aa		32.23	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.22	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.21	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.21	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
DGCR6-208	ENST00000608842	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DGCR6-208	ENST00000608842	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DGCR6-208	ENST00000608842	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.15	■■■□□ 2.74
DGCR6-208	ENST00000608842	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.14	■■■□□ 2.74
DGCR6-208	ENST00000608842	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
DGCR6-208	ENST00000608842	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.12	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.12	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.11	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.11	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	PTPRM	P28827	1452 aa		32.09	■■■□□ 2.73
DGCR6-208	ENST00000608842	PANK3	Q9H999	370 aa		32.06	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.03	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.02	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.72
DGCR6-208	ENST00000608842	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.99	■■■□□ 2.71
DGCR6-208	ENST00000608842	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.98	■■■□□ 2.71
DGCR6-208	ENST00000608842	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
DGCR6-208	ENST00000608842	RALBP1	Q15311	655 aa		31.96	■■■□□ 2.71
DGCR6-208	ENST00000608842	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.95	■■■□□ 2.71
DGCR6-208	ENST00000608842	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.95	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	STK26	Q9P289	416 aa		31.93	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	SLIT1	O75093	1534 aa		31.93	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.92	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.91	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
DGCR6-208	ENST00000608842	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	MET	P08581	1390 aa		31.87	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.86	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	LTK	P29376	864 aa		31.86	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.85	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.85	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.85	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.85	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		31.84	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
DGCR6-208	ENST00000608842	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.82	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.82	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.81	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	MED14	O60244	1454 aa		31.81	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.79	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	TECPR2	O15040	1411 aa		31.79	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68

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