RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MSH5O43196 834 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDCA8Q53HL2 280 aa29.14■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPATQ14207 1427 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYOM2P54296 1465 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOS1P29475 1434 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA6Q8N139 1617 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MROH2AA6NES4 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF1BO60333 1816 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP2R1AP30153 589 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNMO15061 1565 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRB3O60242 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERVK-7P63135 1459 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEO1Q92859 1461 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC3O15438 1527 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE3BQ13370 1112 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFT172Q9UG01 1749 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYOM1P52179 1685 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIK3C2GO75747 1445 aa28.89■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.89■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC24A1O60721 1099 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INSRP06213 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IDI1Q13907 227 aa28.81■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.81■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPLO60437 1756 aa28.81■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLIN1O60240 522 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRB1O14514 1584 aa28.78■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RICTORQ6R327 1708 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.7■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STK26Q9P289 416 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIK3C2BO00750 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APAF1O14727 1248 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.68■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MORC1Q86VD1 984 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA2Q08379 1002 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF521Q96K83 1311 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GLI2P10070 1586 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CABP2Q9NPB3 220 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EVC2Q86UK5 1308 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRBNQ96SW2 442 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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