RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.77■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.77■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.77■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.77■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.76■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 USP47Q96K76 1375 aa36.76■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
SCAMP4-210ENST00000588555 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.73■■■■□ 3.47
SCAMP4-210ENST00000588555 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
SCAMP4-210ENST00000588555 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3C2GO75747 1445 aa36.7■■■■□ 3.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFYVE9O95405 1425 aa36.69■■■■□ 3.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP1Q9C000 1473 aa36.65■■■■□ 3.46
SCAMP4-210ENST00000588555 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.46
SCAMP4-210ENST00000588555 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.63■■■■□ 3.46
SCAMP4-210ENST00000588555 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.61■■■■□ 3.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.6■■■■□ 3.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IQGAP1P46940 1657 aa36.6■■■■□ 3.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.56■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.54■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.53■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.53■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.52■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRB1O14514 1584 aa36.51■■■■□ 3.44
SCAMP4-210ENST00000588555 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.5■■■■□ 3.43
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC7Q96M83 1385 aa36.46■■■■□ 3.43
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.45■■■■□ 3.43
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.41■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.39■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 TESK2Q96S53 571 aa36.39■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRMP28827 1452 aa36.39■■■■□ 3.42
SCAMP4-210ENST00000588555 ALKQ9UM73 1620 aa36.38■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SLIT1O75093 1534 aa36.38■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.37■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.36■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.35■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
SCAMP4-210ENST00000588555 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SCAMP4-210ENST00000588555 LTKP29376 864 aa36.27■■■■□ 3.4
SCAMP4-210ENST00000588555 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.25■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.24■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.23■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 MIER1Q8N108 512 aa36.21■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.2■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.2■■■■□ 3.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TMF1P82094 1093 aa36.19■■■■□ 3.38
SCAMP4-210ENST00000588555 EID1Q9Y6B2 187 aa36.19■■■■□ 3.38
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.17■■■■□ 3.38
SCAMP4-210ENST00000588555 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.17■■■■□ 3.38
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.13■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 MED14O60244 1454 aa36.13■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 METP08581 1390 aa36.13■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC24A1O60721 1099 aa36.1■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 STK26Q9P289 416 aa36.1■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 DLC1Q96QB1 1528 aa36.09■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.07■■■■□ 3.37
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC11Q96J66 1382 aa36.06■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 BCANQ96GW7 911 aa36.05■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.04■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CDCA8Q53HL2 280 aa36.03■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 DIP2AQ14689 1571 aa36.03■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 TECPR2O15040 1411 aa36.02■■■■□ 3.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAM1Q96QH2 718 aa35.99■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.98■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 CPS1P31327 1500 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TBX22Q9Y458 520 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 MYOM1P52179 1685 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ANP32CO43423 234 aa35.94■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 POGKQ9P215 609 aa35.92■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.92■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRUQ92729 1446 aa35.92■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 SIRT1Q96EB6 747 aa35.92■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.9■■■■□ 3.34
SCAMP4-210ENST00000588555 EVC2Q86UK5 1308 aa35.87■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.87■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.84■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3R4Q99570 1358 aa35.83■■■■□ 3.33
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