RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 RCCD1A6NED2 376 aa9□□□□□ -0.97
PTPRM-215ENST00000583289 GNPATO15228 680 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-215ENST00000583289 FAM161AQ3B820 660 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-215ENST00000583289 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-215ENST00000583289 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRM-215ENST00000583289 GPR37O15354 613 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 COPS2P61201 443 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF516Q92618 1163 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 CFHP08603 1231 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 ZPR1O75312 459 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 FECHP22830 423 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 GGCXP38435 758 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRM-215ENST00000583289 SLC10A3P09131 477 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 NR1I2O75469 434 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 SULF1Q8IWU6 871 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 MAP2K5Q13163 448 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 RDH13Q8NBN7 331 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRM-215ENST00000583289 LAPTM4AQ15012 233 aa8.82□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 TLL1O43897 1013 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 PHOX2BQ99453 314 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 ADH1BP00325 375 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP7Q8WX94 980 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 RNF223E7ERA6 249 aa8.78□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 IRF6O14896 467 aa8.78□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 GCGRP47871 477 aa8.78□□□□□ -1
PTPRM-215ENST00000583289 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 S1PR4O95977 384 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 ATP6V1AP38606 617 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 FUT2Q10981 343 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 GFRA3O60609 400 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 MORN1Q5T089 497 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 Q6ZNB5 142 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 SPSB2Q99619 263 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC102AQ96A19 550 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 SLC19A1P41440 591 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-215ENST00000583289 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 CD46P15529 392 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 CLCN1P35523 988 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 THAP11Q96EK4 314 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 USP46P62068 366 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 Q3C1V9 767 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 KDM4AO75164 1064 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 SPRYD7Q5W111 196 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 MSS51Q4VC12 460 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 BRICD5Q6PL45 260 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 BARGINQ6ZT62 677 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 ZMYND10O75800 440 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRR20EP86478 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRR20CP86479 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRR20DP86480 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRR20BP86481 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRR20AP86496 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 HOXA2O43364 376 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 RPIAP49247 311 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-215ENST00000583289 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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