RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TESK2Q96S53 571 aa36.53■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPLO60437 1756 aa36.51■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.51■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MLECQ14165 292 aa36.5■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.5■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.49■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.42■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.41■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMF1P82094 1093 aa36.4■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIK3C2GO75747 1445 aa36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IDI1Q13907 227 aa36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ERVK-7P63135 1459 aa36.37■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.37■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.35■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.26■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC184Q52MB2 194 aa36.25■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZFYVE9O95405 1425 aa36.25■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.25■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.24■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.23■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRB1O14514 1584 aa36.23■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPRMP28827 1452 aa36.22■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CDCA8Q53HL2 280 aa36.22■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MRS2Q9HD23 443 aa36.22■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC24A1O60721 1099 aa36.2■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.15■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.14■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RALBP1Q15311 655 aa36.13■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PANK3Q9H999 370 aa36.12■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZMYM3Q14202 1370 aa36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.07■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.06■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYOM1P52179 1685 aa36.05■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.05■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.04■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.04■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM9BQ8IZU0 186 aa36.02■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.02■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C3P01024 1663 aa35.99■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.98■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMC1Q8TDI8 760 aa35.93■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.93■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNRQ92752 1358 aa35.92■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ALKQ9UM73 1620 aa35.9■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.9■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP13Q86W25 1043 aa35.89■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.82■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.81■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.8■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.78■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STK26Q9P289 416 aa35.78■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EVC2Q86UK5 1308 aa35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP1Q9C000 1473 aa35.74■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.73■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.69■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DLC1Q96QB1 1528 aa35.69■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.69■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRAM1Q96QH2 718 aa35.67■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POGKQ9P215 609 aa35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms