RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP33O14559 1287 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH8Q96L42 1107 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 CD46P15529 392 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 EMP3P54852 163 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 SULF1Q8IWU6 871 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 SCRIBQ14160 1630 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
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PTPRM-208ENST00000578600 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 MARVELD3Q96A59 401 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRM-208ENST00000578600 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRM-208ENST00000578600 POTEB3A0JP26 581 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 POTEBQ6S5H4 581 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 ZMYND15Q9H091 742 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.08□□□□□ -0.8
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PTPRM-208ENST00000578600 FLIIQ13045 1269 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 ERCC6Q03468 1493 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 SPTLC1O15269 473 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-208ENST00000578600 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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PTPRM-208ENST00000578600 SLC10A3P09131 477 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-208ENST00000578600 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.02□□□□□ -0.81
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PTPRM-208ENST00000578600 LILRB3O75022 631 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRM-208ENST00000578600 BANK1Q8NDB2 785 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 HRO43593 1189 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 SLF2Q8IX21 1173 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 NCAPD3P42695 1498 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 A6NJR5 290 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 QPCTQ16769 361 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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PTPRM-208ENST00000578600 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 FDX1P10109 184 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 SLC4A3P48751 1232 aa9.91□□□□□ -0.82
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PTPRM-208ENST00000578600 CFHP08603 1231 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-208ENST00000578600 HRCP23327 699 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 GUCA2AQ02747 115 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 FUT2Q10981 343 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 POM121Q96HA1 1249 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 SOCS7O14512 581 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 TRAK2O60296 914 aa9.86□□□□□ -0.83
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