RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576460.5

NOMO3-216, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-216ENST00000576460 SYNMO15061 1565 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.58□□□□□ -0.55
NOMO3-216ENST00000576460 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 ADGRB3O60242 1522 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 IFT172Q9UG01 1749 aa11.56□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 PPLO60437 1756 aa11.56□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 TNRQ92752 1358 aa11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 MYOM2P54296 1465 aa11.55□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.54□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 C3P01024 1663 aa11.54□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.54□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.53□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.53□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 MADDQ8WXG6 1647 aa11.53□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 ZFYVE9O95405 1425 aa11.52□□□□□ -0.56
NOMO3-216ENST00000576460 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.52□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.52□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 LAMC1P11047 1609 aa11.51□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 NLRP1Q9C000 1473 aa11.51□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.51□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 USP47Q96K76 1375 aa11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.5□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.48□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 PIK3C2GO75747 1445 aa11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-216ENST00000576460 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.45□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.43□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 IQGAP1P46940 1657 aa11.43□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 EID1Q9Y6B2 187 aa11.43□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 CCDC7Q96M83 1385 aa11.41□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 PTPRMP28827 1452 aa11.41□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.41□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.4□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.4□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.4□□□□□ -0.58
NOMO3-216ENST00000576460 SLIT1O75093 1534 aa11.4□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ALKQ9UM73 1620 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ADGRB1O14514 1584 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 TMF1P82094 1093 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 CDCA8Q53HL2 280 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 TESK2Q96S53 571 aa11.39□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 BCANQ96GW7 911 aa11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 LTKP29376 864 aa11.37□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.37□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.36□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 SIRT1Q96EB6 747 aa11.35□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.35□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 TBX22Q9Y458 520 aa11.35□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.35□□□□□ -0.59
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NOMO3-216ENST00000576460 ABCC11Q96J66 1382 aa11.34□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 STK26Q9P289 416 aa11.34□□□□□ -0.59
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NOMO3-216ENST00000576460 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.34□□□□□ -0.59
NOMO3-216ENST00000576460 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.33□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 POGKQ9P215 609 aa11.33□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.32□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 MIER1Q8N108 512 aa11.32□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NOMO3-216ENST00000576460 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.32□□□□□ -0.6
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