RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 ADGRB3O60242 1522 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 UNC13BO14795 1591 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 KCNA6P17658 529 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 NOS1P29475 1434 aa25.2■■□□□ 1.63
SPNS2-204ENST00000571386 IDI1Q13907 227 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 MSH6P52701 1360 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 NUP155O75694 1391 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS2-204ENST00000571386 JCADQ9P266 1359 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 E9PCH4 1651 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 BCANQ96GW7 911 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 SLAIN2Q9P270 581 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 ZFYVE9O95405 1425 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 LRP6O75581 1613 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 SHPRHQ149N8 1683 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 NAIPQ13075 1403 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS2-204ENST00000571386 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 HFM1A2PYH4 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 DIP2AQ14689 1571 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS2-204ENST00000571386 C14orf37Q86TY3 774 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 TRIM52Q96A61 297 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 TBX22Q9Y458 520 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS2-204ENST00000571386 TRPM2O94759 1503 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 ATF3P18847 181 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 PIK3R4Q99570 1358 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS2-204ENST00000571386 RXRBP28702 533 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 DCCP43146 1447 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 CLTCL1P53675 1640 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 PTPRUQ92729 1446 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 BRINP3Q76B58 766 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 KIF1BO60333 1816 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS2-204ENST00000571386 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 AFF2P51816 1311 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 MST1RQ04912 1400 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 RGS12O14924 1447 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS2-204ENST00000571386 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 FOXD1Q16676 465 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 C8orf37Q96NL8 207 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 EP400Q96L91 3159 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-204ENST00000571386 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 LAMC1P11047 1609 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 METP08581 1390 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 PPLO60437 1756 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-204ENST00000571386 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-204ENST00000571386 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-204ENST00000571386 ADAMTS2O95450 1211 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-204ENST00000571386 NGLY1Q96IV0 654 aa24.53■■□□□ 1.52
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